1. 行政組織上，已正式成立「分子醫學研究中心」，其為本校的一級單位，負責規劃督導中心之發展及研究相關業務。

2. 緊密結合大學與長庚醫院之研究能量。「分子醫學研究中心」推展運作過程中，將主動發布研究訊息到鄰近學校如中央大學、中原大學及元智大學等。邀請有相關研究興趣之鄰校教授及研究者參予合作性之研究。

3.    已建立定期自我評鑑機制，訂定各項教學、研究及行政指標，依項評審。配合中心的建立，此等自我評鑑將置於校務諮詢委員會的指導下進行；此外亦組成「校內考評委員會」，定期考核各系教學、研究之推展情形。

4. 教學資源中心大力推動「教師成長」工作，協助提昇全校教師教學技巧及效率。

5. 通識中心推動成立「語言中心」，改善英文教學及建立英文自我學習網路系統，制訂畢業生英文程度通過之門檻。未來自我學習系統將視需要，增設其他外國語文。

6. 進行雙向教學評鑑（學生及同儕），評審結果納入「教師適任性評量」之項次中。

7. 制訂彈性薪給及福利制度，以延攬國際級人才。

8. 制訂「研究型教授」制度，以加速推通本校研究優質化及國際化，並擇優聘任為校職。

9. 實施「教師適任性評量」，就教學及研究通盤考核，不適任者將不續聘。

10. 研擬降低教授之授課時數辦法，使有更充分時間備課及研究。

11. 擴增實驗動物中心之規模，支援「分子醫學研究中心」之研究，並負責相關之教學、人才培育工作。

12. 實驗動物系統的建立與「分子醫學研究中心」之發展關係密切，推動成立中的實驗動物中心包括線蟲、果蠅、斑馬魚、基因工程鼠等。

13. 因已與國外卓越研究中心合作，故可引進國外成功管理一流研究中心之經驗，協助本中心計劃的順利執行，確保達成預定目標。

14. 本計劃之資源除由政府贊助外，本校亦已積極爭取董事會及長庚醫院之經費補助。由於本校創校時間尚短，畢業校友仍在創業階段，故校友募款還不易推動。